本館標本室典藏標本包含軟體動物、魚類、甲殼類、海洋哺乳類、深海生物、底棲性生物、海鳥類、海洋無脊椎生物、棘皮生物等項目，也包括一些罕見生物像是龍宮貝、皇帶魚、巨口鯊等標本。透過標本民眾不但可近距離觀察生物，標本的典藏與展示更提供民眾一窺平日難得一見之各式海洋生物的機會。標本室解說員除解說基礎生物知識外，亦會分享製作標本過程中，各種酸甜苦辣的有趣故事，使解說更加生動活潑，加深學生學習印象。
水族實驗中心
館藏標本室
溼地公園
墾丁天文台
海生館宿舍